Logiciels disponibles sur le serveur UNIX mis à la disposition des chercheurs

CRITeR, le 21 octobre 2011

Sommaire
alire alire_migration calendrier connexion
dump Editeurs exmh fetchmail
FreeFem++ ftp Getfem++ gimp
gnuplot imagemagick imprimantes java
jeux_de_caractères-MS-Windows maple matlab maxima
messagerie navigateurs nx octave
OpenOffice paraview pdf R
sauvegarde scilab shell smb
spatial-econometrics sshfs Statistics-Gap subversion
Tex_LaTeX thunderbird utilitaires_X ViennaRNA
webdav window_manager www X
xfm xlock


 Quelques notes sur LINUX:

  file:///usr/share/doc/LANG/fr/linux/intro/intro.html
http://www.fr.debian.org/
http://loire.univ-st-etienne.fr/~beberjm/doc/user.html
Tous les logiciels installés ne sont pas décrits ici.

alire (sommaire)


 Vous trouverez ici une description du système et matériel mis en oeuvre.

- système d'exploitation


  DEBIAN lenny 5.0

  Vous retrouverez la version courante en tapant:
  cat /etc/debian_version

- description du matériel


 le 16 sep 2009

  La machine loire n'est pas une machine physique avec son propre matériel
  (CPU, mémoire, disques, interface réseau...). C'est une machine virtuelle
  hébergée sur un cluster animé par VMware ESX 3.5.

  A cette machine virtuelle est attachée quatre processeurs virtuels,
  six Go de mémoire et un disque virtuel (vmfs).

  Le cluster lui est composé de 8 lames SUN blade X6250 comportant
  16 Go de mémoire, deux disques SAS 73 Go à 15000 t/mn en RAID 1,
  deux processeurs Intel Xeon quatre coeurs (X5460 et X5470), 4 ports
  ethernet Gigabit et une carte Fiber Channel 4Gb double port. A ce cluster
  est attaché un SAN comportant une baie de stockage SUN STK6140 avec
  16 disques FC de 300 Go et 16 disques FC de 450 Go.


 Attention! les informations obtenues par les commandes habituelles
            sont trompeuses car elles ne reflètent pas la réalité
            de la machine virtuelle.

 cat /proc/cpuinfo

- logiciels


 De nombreux logiciels sont installés. Ils sont cités dans la suite de ce
 document. Lors de leur installation, une annonce est faite dans le message
 du jour (xmotd).

 Voici quelques sites décrivant des logiciels:

    http://www.projet-plume.org/ressource/journee-plume-outils-libres-math

connexion (sommaire)


 Les connexions en telnet ne sont plus autorisées

- ssh


 ssh -l votre_login loire.univ-st-etienne.fr

 et si vous disposez d'un serveur X

 ssh -X -l votre_login loire.univ-st-etienne.fr
 ou
 ssh -Y -l votre_login loire.univ-st-etienne.fr

- depuis un serveur X


 Via xdmcp

 Un serveur X est disponible en natif sur toute machine linux ou MacOS.

 Sous MS-Windows, vous pouvez installer puis utiliser xming
       http://sourceforge.net/projects/xming

- depuis un client nx


 Sous linux, nxclient se lance en tapant:

          /usr/NX/bin/nxclient &

 nx est disponible sous linux, MacOS, MS-windows ainsi que sur certains
 terminaux légers. Voir le paragraphe consacré à NX.

- Comment se connecter depuis son domicile?


  Vous devez utiliser ssh ou le client nx.

- Comment se connecter depuis le réseau sans fil UJM-SF?


 Connectez-vous au réseau UJM-SF. Obtenez une adresse en lançant un
 navigateur et identifiez-vous. Ensuite la machine loire est accessible
 via ssh ou nx.

     ssh -X votrelogin@loire.univ-st-etienne.fr


nx (sommaire)


 NX Enterprise Server version 3.4.0-8           installé le 9 dec 2009
 NX Enterprise Server version 3.3.0-8           installé le 8 dec 2008
  	
 A complete solution for remote access to your Unix workstation.
  http://www.nomachine.com/
NX permet de se connecter à un serveur UNIX en X de façon sécurisée et efficace. NX Enterprise Server est installé sur la machine loire. Le client NX installé sur votre poste vous permettra de vous connecter à la machine loire. Le client NX est disponible pour les plateformes LINUX, Windows et MAC.

- Comment installer nx-client?


 Télécharger le logiciel qui convient à votre ordinateur
  http://www.nomachine.com/download.php

- Comment configurer nx-client?


 Lancez le client NX et configurez une session pour loire

 La configuration se résume à:

   Donner
         host = loire
         server = loire.univ-st-etienne.fr
         port = 22
         Select type of your internet connection: ADSL ou LAN

   Unix/Custom/Settings
         puis cocher "Run the default X client script on server"
                     "New virtual desktop"

   Select size of your remote desktop:
   Display = Custom  W=1280 H=1024  pour une configuration confortable
   si votre PC le permet.

   On laisse le reste tel qu'il est!



shell (sommaire)


 Plusieurs shell sont à votre disposition. Vous êtes enregistré pour
 utiliser bash. Bash est le seul shell préconfiguré par nos soins à
 partir du fichier /usr/local/etc/skel/.bashrc

 Pour changer de shell, utilisez la commande chsh

    chsh -s /bin/tcsh

 N'oubliez de créer dans votre répertoire d'accueil, les fichiers de
 configuration correspondant, notamment pour adapter le umask par
 défaut qui autorise la lecture à tous de vos fichiers.

 Pour connaitre les shells disponibles, regardez le contenu du
 fichier /etc/shells

 Ont été installés: bash, tcsh, csh


window_manager (sommaire)


 gnome et kde se sont avérés beaucoup trop lourd pour une utilisation
 sur des serveurs X distants. fvwm a été mis pour assurer la continuité.
 xfce4 est le gestionnaire de session par défaut des nouveaux utilisateurs

 Pour passer de l'un à l'autre, adaptez le fichier ~/.xsession puis
 reconnectez vous.

 Pour travailler avec xfce4
  mv ~/.xsession  ~/.xsession.FVWM
  mv ~/.xsession.XFCE4 ~/.xsession
  ou
  mv ~/.xsession  ~/.xsession.FVWM
  cp /usr/local/etc/skel/.xsession ~/.xsession

 Pour travailler avec fvwm
  mv ~/.xsession ~/.xsession.XFCE4
  cp /usr/local/etc/skel/.xsession.fvwm ~/.xsession

- fvwm


 le 13 oct 2008
 Sont liés à l'utilisation de fvwm, les fichiers ~/.xsession et ~./fvwm/

- xfce4


 le 15 oct 2008

 Pour accèlérer l'affichage, vous pouvez
   dans le menu du bureau/Paramètres/Paramètrage des fenêtres/Avancé
   décocher les rubriques Afficher le contenu durant le déplacement
                          Afficher le contenu durant le redimensionnement

 Pour faire afficher sur le bureau une application, par exemple thunderbird,
 créez un lien dans ~/Desktop ou déposez le fichier.

       ln -s /usr/bin/icedove ~/Desktop/thunderbird

 puis pour lancer thunderbird, il faudra double-clic sur "thunderbird"

 Pour ajouter un bouton dans le panneau du bas, cliquez avec le bouton
 droit. Choisissez Ajouter/Lanceur/Ajouter puis configurez la commande à
 exécuter Par exemple, pour ajouter xkill,
       Commande=/usr/bin/xkill
       Icone=/usr/include/X11/pixmaps/mini.bomb.xpm

 Vous retrouvez les boutons ainsi ajoutés dans ~/.config/xfce4/panel/


sauvegarde (sommaire)


 Networker Save and Restore version 7.6.0           le 15 sep 2010
 Networker Save and Restore version 7.4sp2          le 16 oct 2008

 Les sauvegardes sont réalisées avec le logiciel EMC NetWorker de façon
 quotidienne.  Chaque nuit, les fichiers modifiés depuis la dernière
 sauvegarde, sont sauvegardés. Une fois par mois, tous les fichiers sont
 sauvegardés. Les sauvegardes sont centralisées sur un serveur nommé
 savrech.univ-st-etienne.fr.

 Ce logiciel permet la sauvegarde automatique de machines clientes (UNIX,
 LINUX et WNT). Si vous êtes intéressés, contactez la DSI.

 La liste des fichiers sauvegardés est conservée en ligne pendant un
 trimestre. Les supports magnétiques ne sont pas forcément en ligne.  Avant
 de lancer toute restauration, assurez-vous que le support est en ligne et
 si il ne l'est pas, avertissez la DSI.

     Les supports magnétiques sont conservés quatre mois.

     Aucun archivage n'est réalisé.

 Sous UNIX

   nwrecover -s savrech.univ-st-etienne.fr &

        vous permet de récupérer un fichier ou un répertoire mais
        attention! si la bande nécessaire n'est pas en ligne, vous ne
                   pourrez rien faire si il n'y a pas d'opérateur pour
                   monter les bandes.

        Dans le menu Options, vous trouverez "Change Browse Time..." pour
        choisir la date de la sauvegarde qui vous intéresse.

        Dans le menu Selected, vous trouverez "Required Volume..." pour
        voir les volumes nécessaires à la restauration demandée.
             Media Type = LTO Ultrium-3
             Location = HP@0.4.1
             Status = Off-line
        indique que vos données sont sur bande LTO, que la bande est
        dans le chargeur HP@0.4.1 mais n'est pas en ligne. La restauration
        se fera sans intervention d'un opérateur mais sera plus longue
        que si vos données étaient sur disque (Media Type = adv-file)

        Note: Il est plus pratique de se placer dans le répertoire
              du fichier à restaurer avant de lancer nwrecover.

   nwrecover -T 10/5/2007 &

        pour récupérer les fichiers au 5 octobre 2007

   recover -s savrech

        vous offre les mêmes services que nwrecover mais en mode caractère
        et non graphique. Vous devez sélectionner les fichiers à restaurer
        avec la commande add. Les commandes cd et ls vous permettent de
        parcourir les différents répertoires.

        La commande changetime vous permet de naviguer dans le temps,
        "changetime 01/02/2000" vous ramènera à l'état de vos fichiers au 2
        jan 2000.

        Finalement, la commande recover lancera la restauration.

        Utilisez la commande help pour en savoir plus (ou man recover).

             ls -lStr
                  # liste les fichiers avec la date de sauvegarde

             add monfichierarestaurer
                  # ajoute le fichier "monfichierarestaurer" à la liste
                  # des fichiers à restaurer

             volumes
                  # affiche les volumes nécessaires à la restauration

             recover
                  # lance la restauration

             quit

        Le message ci-dessous
           Volumes needed (all on-line):
                QB7838L3 at HP@0.4.1
                cridon01.RO at /dbo/cridon/_AF_readonly
           Total estimated disk space needed for recover is 21 MB.
        indique que la restauration nécessite l'usage de la bande QB7838L3
        que cette bande est disponible dans le chargeur de bande HP@0.4.1
        et que la restauration utilisera aussi le disque cridon01.RO

        Tout est donc en ligne. Celà nécessite aucune intervention mais
        il faut patienter pour permettre au chargeur de sélectionner la
        bande, ce qui peut demander plusieurs minutes!


 Vous pouvez demander que tel répertoire, ou tel fichier ne soit pas
 sauvegardé. Pour cela, vous créez dans le répertoire, un fichier ayant pour
 nom .nsr et contenant les consignes de sauvegarde. Par exemple:

          +skip: .?* *
                pemettra de ne pas sauvegarder le répertoire et son contenu

          +skip: *.log
                permettra de ne pas sauvegarder les fichiers ayant pour
                suffixe .log

 Sous Window, demandez à l'administrateur de votre machine.


navigateurs (sommaire)


- iceape


 installé le 16 oct 2008 en version 1.1.12

 iceape est l'équivalent de seamonkey. Il est activé par la commande mozilla
 Il est installé par un paquet DEBIAN

 Nous vous conseillons pour retrouver les informations sur cette machine
 de mettre en page d'accueil le fichier

       file:///usr/local/journal/welcome.html
iceape/Edition/Préférences.../Navigateur/Ma page d'accueil/Chosir un fichier Le cache-proxy a été préconfiguré. Vous n'avez rien à faire. iceape/Edition/Préférences.../Avancées/Proxies/ Choisir la rubrique "URL de configuration automatique du proxy:" et lui affecter la valeur: http://www.univ-st-etienne.fr/proxy.pac
-- rechercher avec iceape

 le 4 dec 2008

 Si le bouton "Rechercher" ne marche pas, allez dans le menu
 "Edition/Préférences.../Navigateur/Recherche sur internet"/ à la rubrique
 "Rechercher en utilisant:" Askjeeves
 et choisissez un autre moteur de recherche, Google par exemple


-- impossible d'ouvrir les pages https

 le 22 dec 2008 (iceape version 1.1.13)

 Vous n'arrivez pas à ouvrir une URL en https et vous obtenez un message:

  Could not initialize the browser's security component... If you continue
  to use this browser session, you might see incorrect browser behaviour
  when accessing security features.

 arrêter mozilla (iceape)
 mv .mozilla .mozilla_atuer
 relancer mozilla

 puis rm -rf .mozilla_atuer

-- Comment retrouver les touches de type emacs?

  Créez le fichier ~/.gtkrc-2.0 contenant la ligne

         gtk-key-theme-name = "Emacs"

  et relancez votre navigateur.

- firefox


 iceweasel version 3.0.6-1                      installé le 22 avril 2009

  Renommé iceweasel sous DEBIAN est aussi disponible.

  Si vous avez des problèles avec https, utilisez iceweasel à la place de
  iceape.


- lynx


 Lynx Version 2.8.7dev.9                    installé le 21 janvier

 lynx-cur - Text-mode WWW Browser
 navigateur en mode curseur plein écran



java (sommaire)


 Sun Java(TM) Runtime Environment (JRE) 5.0
 Sun Java(TM) Runtime Environment (JRE) 6

 Ont été installés les paquet DEBIAN non-free
        sun-java5-jre
        sun-java5-plugin

        sun-java6-jre
        sun-java6-plugin

 C'est la version java6 qui est active par défaut.


thunderbird (sommaire)


 icedove - Clone de Thunderbird (courriel/nouvelles/rss) libre/démarqué
 icedove-l10n-fr - Paquet de langue française pour Icedove

 Nous avons ajouté un lien thunderbird sur icedove, donc vous pouvez
 taper icedove ou thunderbird pour l'activer.

- codage


 La machine est par défaut en ISO8859-15. Il convient d'adapter le codage
 pour afficher correctement les messages.


exmh (sommaire)


 exmh - extensible X user interface for MH mail
 nmh - A set of electronic mail handling programs

 exmh version 2.7.2-16                   installée le 25 nov 2008

- Où trouver de l'aide pour utiliser exmh?


 Dans les menus de exmh, vous trouverez de l'aide
 Vous retrouvez ces informations à:
  file:///usr/share/doc/exmh/html/index.html

- Comment migrer exmh depuis ondenon?


   mv .mh_profile .mh_profile_ondenon
   mv ondenon/.signature .signature
   exmh &

   ensuite configurer comme ci-dessous

- Comment configurer exmh?


  Configurez via le bouton "Preferences" puis utilisez le bouton "Save"
  pour quitter et sauvegarder votre configuration.

    exmh/Preferences/The Top Ten/
                Maihost for POP3 protocol=pop.univ-st-etienne.fr

    exmh/Preferences/The Top Ten/
                Background processing = Inc
                  pour relever automatiquement le courrier
                Use faces database = off
                Automatic address saving = off
                  pour ne pas enregistrer automatiquement les adresses
                  expéditeurs

    exmh/Preferences/Html Viewer/
                HTTP Proxy Server = cache.univ-st-etienne.fr
                HTTP Proxy Port = 3128

    exmh/Preferences/Simple Editor/
                Quoted-printable default = never

    exmh/Preferences/Bayesian Spam Filter
              Use a Bayesian spam filter = On
              Spam Program = bogofilter
              Is spam mismarked? = on
              Other--Spam =
              Other--Non-Spam =
              Spam Procedure = refile
              Spam Folder = inbox/bogo
                  Ne pas oublier de créer le folder inbox/bogo (bouton new)
              Ham Procedure = refile
              Ham Folder = inbox
              Feed messages on STDIN? = on

  Pour faciliter la vision des dossiers existants, on peut
   exmh/Preferences/Folder Display/Max fdis rows = 3


- Comment prétraiter les messages avec procmail?


  On a mis à votre disposition le fichier ~/.procmailrc.exmh et le fichier
  ~/.procmail.exmh/rc.test. Vous pouvez les utiliser tels quels ou les
  modifier. Ils permettent de classer dans des dossiers différents les
  messages non sollicités (spam).

  Pour les utiliser, il faut

    exmh/Preferences/Incorporate Mail
           Ways to Inc = presort
           Method used to filter incoming mail = procmail
           Additional arguments to procmail = $env(HOME)/.procmailrc.exmh

  Ces deux fichiers sont mis en place à la création du compte et sont
  préconfigurés pour utiliser le logiciel anti-spam bogofilter. Il vous faut
  créer les dossiers inbox/unsure et inbox/bogo, si ce n'est pas fait déjà
  fait:

   exmh/New/
       Folder Name = inbox/unsure
   exmh/new/
       Folder Name = inbox/bogo


 Pour afficher les sous-dossiers de inbox, il faut cliquer sur inbox avec
 le bouton du milieu. On doit voir bogo et unsure

 Configurer "Bayesian Spam Filter" comme nous l'avons décrit dans le
 paragraphe précédent.

 Redémarrer exmh.

 Ensuite, il suffit de jouer avec les boutons du menu "spam..." pour que
 bogofilter apprennent ce qu'est un message désiré (ham) ou un message
 indésirable (spam). Bogofilter marque les messages ainsi:

    Ham        un bon message. Il va dans inbox
    Spam       un message non désiré. Il va dans inbox/bogo
    Unsure     un message douteux. Il va dans inbox/unsure

 Vous devez classer les messages unsure avec "Spam.../Learn as spam"
 ou "Spam.../Learn as ham".

 N'oubliez régulièrement de vider les dossier inbox/bogo et inbox/unsure

 Si vous utilisez le logiciel spamassassin au niveau du serveur de
 messagerie, vous devez créer le dossier inbox/spam. Il contiendra les
 messages marqués SPAM au niveau du serveur de messagerie. Voir la rubrique
 "Configurer..." dans le menu obtenu par:
        https://mailhost.univ-st-etienne.fr/messagerie.html
pour mettre en oeuvre ce marquage.

- Comment utiliser mozilla comme navigateur?


    exmh/Preferences/WWW
                Scan for URLs in messages = On
                URL Viewer = netscape
                Netscape command = mozilla -remote openURL($xuri,new-window)

  Ca permet de rendre cliquable les URL et d'ouvrir une nouvelle fenêtre
  dans mozilla déjà actif.

- Comment dévalider ispell à la frappe?


 Ispell analyse le texte tapé et sous-ligne chaque mot en erreur. Mettre Off
 permet de ne pas utiliser Ipsell à la frappe. Il peut être lancé dans la
 fenêtre de composition du message par le menu More.../Spell...  après avoir
 configuré ainsi:

    exmh/Preferences/Simple Editor/
                spell program = ispell

    exmh/Preferences/I-Spell
                Turn Ispell On/Off = Off
                Re-Verify after Adds = Off


- Comment ne pas afficher les images contenues dans les messages?


    exmh/Preferences/Html Viewer
                Enable display of in-line images = Off
    exmh/Preferences/MIME/show Images = Off
                    pour éviter l'affichage des images en ligne.


- Comment ajouter automatiquement sa signature aux messages composés?


   Composez votre signature dans le fichier ~/.signature
 	Preferences/Simple Editor
 		    Automatically sign messages = On

- Comment avoir plusieurs signatures possibles?


     Chaque signature doit se trouver dans un fichier ~/.signature*
     Il faut avoir
 	Preferences/Intelligent Signatures
 		    Intelligent sign default = On
     Il faut redémarrer exmh pour qu'il découvre les différents fichiers
     signatures et vous propose dans la fenêtre de composition le bouton
     "Sign..." au lieu de "Sign" qui vous permet de choisir votre signature.


- Comment relever le courrier?


   Utiliser le bouton "Inc"

 Le bouton INC provoque la relève du courrier. A la première relève, votre
 login et password vous est demandé. Attention! si les informations données
 sont erronées, rien ne l'indique. Aucune relève de courrier n'aboutit.

 La relève peut se faire à intervalle régulier sans réclamer à chaque relève
 le mot de passe. Il faut dans le menu

      Preferences/Background Processing
                 Background Processing = Inc
                 Period (minutes) = 10

 Merci de ne pas descendre au dessous de 10 minutes pour la période de
 relève.

 La fonction INC place les nouveaux messages dans ~/Mail/inbox et dans les
 dossiers précisés par les filtres définis.

 Les commandes xbiff, mail pour tester si un message est arrivé, ne
 peuvent donc pas être utilisées telles quelles.  Par contre, à l'arrivée
 de nouveau courrier, exmh vous prévient par son icône (boîte aux lettres
 avec drapeau relevé). Vous pouvez aussi faire émettre un bip:

     exmh/Preferences/Sound/
             Sound feedback: Off
             Use Terminal Bell: On

- Comment utiliser joe comme "Alternate Editor"?


     exmh/Preferences/Editor Support/
       2nd Editor command = exmh-async xterm -e joe -asis -rmargin 72

 Si la fenêtre xterm n'apparait pas, vérifiez que xhost donne une liste
 vide.


- Comment configurer exmh pour interroger l'annuaire LDAP?


 exmh sait interroger l'annuaire LDAP. Pour interroger l'annuaire des
 personnels, exmh 2.7.2 doit être configuré ainsi:

   exmh/Preferences/Address Database/
         LDAP Server         = -h ldap.univ-st-etienne.fr
         LDAP Search Root    = -b "ou=people,dc=univ-st-etienne,dc=fr"
         LDAP Encoding       = utf-8
         LDAP search program = ldapsearch.sh

 La recherche dans l'annuaire s'active par CTRL-TAB dans un champ To: ou
 Cc: après avoir tapé le début du nom.

 Si CTRL-TAB n'est pas utilisable, vous pouvez utiliser CTRL-g en
 configurant:

   exmh/Bindings.../Simple Edit/addexpand = <Control-g>

 L'annuaire complet de l'université pourra être interrogé en configurant
         LDAP search program = ldapsearch_all.sh
 Les autres paramètres restent identiques.

- Comment interroger LDAP?


 On suppose que la configuration a été réalisée.

 Dans la fenêtre de composition <Comp>, dans les champs destinataires To:,
 Cc:, Bcc:, il faut commencer à taper le nom puis appuyer sur CTRL-TAB.  Une
 fenêtre s'ouvre avec la liste. La sélection s'est faite sur l'adresse et le
 nom complet. Attention! on ne peut choisir qu'une adresse.


- Comment afficher en plus gros les messages en UTF-8?


 Souvent les messages reçus et codés avec l'entête
   Content-type: text/plain; charset="UTF-8"
 sont affichés en petits caractères.

 Arrêter exmh
 Modfier le fichier .exmh/exmh-defaults en ajoutant au début les lignes
 suivantes:

 *mime_utf-8_registry:      iso10646
 *mime_utf-8_encoding:      1
 *mime_utf-8_plain_families:  courier
 *mime_utf-8_fixed_families:  fixed
 *mime_utf-8_proportional_families:  courier
 *mime_utf-8_title_families:   courier

 Relancer exmh.

- Comment relever d'autres BAL?


  Une des méthodes possibles est d'utiliser fetchmail. Pour celà, il faut

   a) créer le fichier ~/.fetchmailrc puis  chmod 600 ~/.fetchmailrc
      par exemple
           #
           poll imap.free.fr interval 10 with proto IMAP
             username dupond-et-dupont password "tintin" keep
             mda "/usr/bin/procmail -d %T"

   b) utiliser les ressources procmail déjà défini

       ln -s .procmailrc.exmh .procmailrc

   c) rajouter un bouton pour activer fetchmail en insérant les lignes
      suivantes dans ~/.exmh/exmh-defaults

     *Fops.ubuttonlist:      fetchmail
     *Fops.fetchmail.text:   Fetchmail
     *Fops.fetchmail.command: exec xterm -ls -sb -fn 9x15 -T fetchmail
       -e /usr/bin/fetchmail --norewrite

    d) relancer exmh puis cliquer sur le bouton fetchmail relèvera
       le courrier de dupond-et-dupont@free.fr en le laissant sur
       le serveur (keep).

- Comment traiter les dossiers couramment utilisés?


 Les dossiers (folders) couramment utilisés sont affichés dans une zone
 entre la liste des dossiers et la liste des messages.

 Pour ne pas afficher cette zone, il faut:
   exmh/Preferences/Folder Cache/Num cached folder lines = 0

- Comment afficher de préférence la version texte du message ?


   exmh/Preferences/MIME/"multipart/alternative precedence" =
       text/plain text/richtext text/html

- Ce qu'il ne faut pas faire?


   Les messages étant numérotés, il ne faut pas créer un dossier avec comme
   nom un numéro.


fetchmail (sommaire)


 fetchmail permet de relever son courrier. Aucune configuration n'a été
 faite. Ce logiciel est simplement installé pour permettre à ses adeptes de
 continuer à l'utiliser. Voir le paragraphe exmh.

  ATTENTION! Pour éviter de renvoyer en boucle tous vos messages,
             il est impératif de mettre dans .fetchmailrc la ligne

                  mda "/usr/bin/procmail -d %T"


messagerie (sommaire)


 De nombreux clients de messagerie sont à disposition. Un paragraphe
 complet est consacré à exmh et thunderbird.

- mutt


- alpine


  alpine  version 1.10                           installé le 20 jan 2009

  C'est un produit sous licence GPL issu de pine

  alpine est préconfiguré pour relever votre courrier à l'université
  avec le protocole imap. Voir le fichier /etc/pine.conf ou ~.pinerc

- claws-mail


 claws-mail version  3.5.0                       installé le 26 nov 2009

 claws-mail est un agent de messagerie gérant les dossiers MH. Il peut
 remplacer exmh.

   man claws-mail

    file:///usr/share/doc/claws-mail/fr/claws-mail-manual.html
claws-mail peut partager automatiquement les rendez-vous du module vcalendar avec orage de XFCE. mairix version 0.21 installé le 8 fev 2010 Le moteur de rechercher mairix a été installé. Il est utilisable avec claws-mail via le script /usr/local/bin/mairix.sh

- evolution


  evolution version 2.22.3                       installé le 23 juin 2010

 evolution comporte un agent de messagerie, un calendrier, un gestionnaire
 de tâches et de contacts...

 Il est capable de prendre en compte vos messages gérés auparavant par MH
 avec exmh par exemple.


Editeurs (sommaire)


 Sont mis à dispositions plusieurs éditeurs, notamment:

- vim


 vim et ses variantes en X gvim

- joe


 Attention! joe ne connait pas la réponse o pour oui, il faut taper y même
            si il propose o comme réponse possible.

- emacs




calendrier (sommaire)


 ical était disponible sur ondenon mais n'existe plus depuis DEBIAN 3.0

 Vous pouvez utiliser le calendrier mis à disposition dans l'ENT
  http://ent.univ-st-etienne.fr/
ou vous pouvez utiliser un des produits ci-dessous

- xcal


 xcal - a graphical calendar with memos and reminder alarms

 man xcal

- tkremind


 tkremind - Tk GUI interface to remind
 man tkremind

- iceowl


  iceowl est le nom DEBIAN pour sunbird

  Iceowl est une application de calendrier basée sur Mozilla. Le but est de
  produire une application indépendante multi-plate-forme utilisant le
  langage d'interface utilisateur XUL.

  Vous le trouvez dans le menu xfce à la rubrique bureautique/iceowl calendar

  iceowl reconnait les formats iCalendar(ICS), CalDAV, WCAP(Sun java...)

- orage


 orage - Calendar for Xfce Desktop Environment

 orage est le calendrier de xfce4. Vous le trouvez à la rubrique
 bureautique/calendrier du menu xfce.

 man orage



xlock (sommaire)


 le 29 oct 2008

 xlock n'est plus disponible. Il a été remplacé par xscreensaver.
 Quand vous vous connectez en X, un démon xscreensaver est lancé. Il sert
 d'économiseur et de verrou. Xlock servait à verrouiller l'accès à votre
 session sans la déconnecter.

 Pour régler xscreensaver, tapez
        xscreensaver-demo &
 Pour vérrouiller l'écran, tapez
        xscreensaver-command -lock

 L'accès à xscreensaver dans sa fonction de verrou a été conservé sous la
 commande xlock.

 xscreensaver est bien entendu accessible via les menus.

 Ne pas oublier qu'une session ouverte est consommatrice de ressources,
 utilisez donc xscreensaver avec parcimonie.



imprimantes (sommaire)


 le 24 oct 2008

 Elles sont gérées par le logiciel CUPS.

 Pour voir quelles imprimantes sont disponibles, utilisez la commande unix:

         lpstat -p -d

 ou connectez-vous à   http://localhost:631/printers/
Certains laboratoires ont demandé à ce que leurs imprimantes soient accessibles. Avant d'utiliser ces imprimantes, vous devez obtenir l'accord des laboratoires en question. Merci. L'imprimante e-c4100ps de la DSI est la seule accessible librement. Pour récupérer vos impressions, vous trouverez à gauche en rentrant à la DSI à la métare (ex CRITeR) un classeur métallique. Vos pages y sont rangées par ordre alphabétique (login name) lpstat -o va vous montrer toutes les impressions en attente lpstat -U $USER va vous montrer toutes vos impressions en attente cancel job-id va détruire l'impression beberjm@loire:~$ lpstat -o -U beberjm phaser780-5463 beberjm 18432 lun 18 jan 2010 14:44:25 CET phaser780-5465 beberjm 48128 lun 18 jan 2010 14:44:29 CET beberjm@loire:~$ cancel phaser780-5463 beberjm@loire:~$ lpstat -o -U beberjm phaser780-5465 beberjm 48128 lun 18 jan 2010 14:44:29 CET beberjm@loire:~$

- xpp


 Nous conseillons d'utiliser xpp (X Printing Panel) de préférence
 aux outils xfce/Accessoires/Gestionnaire d'impression.

 xpp est plus riche. Il permet de définir des instances d'imprimantes qui
 permettent d'utiliser la même imprimante mais avec une configuration
 différente, par exemple pour imprimer soit en noir et blanc soit en
 couleur. Votre configuration de xpp se trouve dans le fichier ~/.lpoptions

 Utilisez aussi xpp pour définir votre imprimante par défaut.
 Attention: si vous avez défini la variable d'environnement PRINTER, celle-ci
 reste l'imprimante par défaut pour xpp.

- serveur d'impression


 Cette machine est configurée en serveur d'impression. Elle peut être
 utilisée pour faciliter la configuration d'imprimante sur les postes de
 travail linux, Mac ou MS-Windows.

 Pour linux, installez cups-client et configurez /etc/cups/client.conf
 avec ServerName loire.univ-st-etienne.fr


alire_migration (sommaire)


 Notes sur la migration de ondenon à loire.

 Cette migration aura lieu entre le 20 févier 2009 et le 21 mars 2009.
 Elle se fera uniquement sur demande. Une fois la migration faite, votre
 compte sur ondenon ne sera plus accessible.

 Après la migration de votre compte de ondenon à loire, tout le contenu du
 votre répertoire d'accueil de ondenon a été placé dans le répertoire
 ~/ondenon/

 Nous avons conservé le même gestionnaire de session, fvwm, pour faciliter
 cette migration. Nous vous invitons cependant à abandonner fvwm pour xfce.
 Allez voir le paragraphe window-manager dans ce document.

 Vous pouvez replacer dans votre répertoire d'accueil ce qui vous intéresse
 avec la commande mv Par exemple, pour replacer le répertoire data, on fera

          mv ~/ondenon/data ~/data

 Une fois fini, vous pouvez détruire le répertoire

          rm -rf  ~/ondenon

 Pour plus de détails, voir
  http://loire.univ-st-etienne.fr/migration.html

maple (sommaire)


 maple15                                     installé le 21 oct 2011
 maple13                                     installé le 26 mars 2010
 maple12                                     installé le 14 janvier 2009

 Nous disposons des licences pour 5 utilisateurs simultanés.
 maple12 et maple13 ne sont plus disponibles.

 Maple is the essential technical computing software for today's engineers,
 mathematicians, and scientists.

      http://www.maplesoft.com/products/Maple/features/index.aspx
maple avec une interface texte très efficace xmaple & avec une interface complète mais lourde et lente. LANG=C xmaple & si les imprimantes ne sont pas accessibles. xmaple -cw & avec une interface graphique plus légère, très rapide LANG=C xmaple -cw & Pour quitter maple, tapez quit xmaple peut être lancé à partir du menu Debian/Applications/Sciences/Mathématiques/ man -M /usr/local/maple/maple15/man/ maple man -M /usr/local/maple/maple15/man/ mint Les manuels téléchargés depuis http://www.maplesoft.com/documentation%5Fcenter/
sont mis à votre disposition. Maple 15 Quick Reference Cards file:////usr/local/maple/maple15/M15QRC_UNIX.pdf
Maple 15 User Manual file:////usr/local/maple/maple15/UserManual-M15.pdf
Maple 15 Programming Guide file:////usr/local/maple/maple15/ProgrammingGuide.pdf
Voir aussi http://www.maplesoft.com/
http://www.mapleapps.com/
http://www.maplenet.fr/
maple peut être utilisée sur votre machine linux 32bits grâce à un montage NFS. Renseignez-vous auprès de la DSI pour vous faire enregistrer puis faites: mkdir -p /usr/local/maple/maple15 mount -t nfs loire:/usr/local/maple/maple15 /usr/local/maple/maple15

matlab (sommaire)


 MATLAB Version 7.10.0.499 (R2010a) installé le 25 mars 2010
 MATLAB Version 7.7.0.471 (R2008b)  installé le 30 oct 2008
 La version R2008b n'est plus disponible.

 avec les toolbox suivantes:

 MATLAB                                    Version 7.10       (R2010a)
 Curve Fitting Toolbox                     Version 2.2        (R2010a)
 Financial Toolbox                         Version 3.7.1      (R2010a)
 MATLAB Compiler                           Version 4.13       (R2010a)
 Optimization Toolbox                      Version 5.0        (R2010a)
 Partial Differential Equation Toolbox     Version 1.0.16     (R2010a)
 Spline Toolbox                            Version 3.3.8      (R2010a)
 Statistics Toolbox                        Version 7.3        (R2010a)
 Symbolic Math Toolbox                     Version 5.4        (R2010a)

 Nous disposons des licences pour 4 utilisateurs simultanés.

 Pour lancer MATLAB

   matlab &
    ou
   matlab -nodesktop

     pour ne pas utiliser l'interface graphique. Cette option permet
     d'afficher en X, les graphiques
       quit    pour quitter matlab
       demos   pour lancer les démonstration
       helpwin pour ouvrir le help
       desktop pour lancer l'interface graphique
       path    pour afficher les répertoires où matlab cherche les fonctions
       print -Pvotre_imprimante  pour imprimer
       ver    pour afficher les versions y compris celles des toolbox

 matlab a été placé dans le menu
   Debian/Applications/Sciences/Mathématiques/

 Pour exécuter un script MATLAB, fichiers .m, au prompt MATLAB, tapez le nom
 du fichier sans le suffixe. Par exemple, j'ai le fichier g.m, sous MATLAB,
 je taperai g

 Pour imprimer, il faut utiliser la commande print de MATLAB en précisant
 -Pvotre_imprimante comme première option. MATLAB a été configuré pour
 imprimer en postscrip couleur (-dps2c).

  Note: Le 12 nov 2008, l'impression à partir du menu file/print provoque
        une erreur java.

 Voir aussi les commandes mbuild, mcc,  mex (Attention! confusion possible
 avec la commande mex de TeX)

 mcc:         Invoke MATLAB Compiler
 mex:         Compile MEX-function from C or Fortran source code
 mbuild :     Compile and link source files into a stand-alone executable or
              shared library

 Pour utiliser MATLAB sur votre machine LINUX sans l'installer en utilisant
 un montage NFS, contactez la DSI pour configurer l'accès puis faites:

        mkdir /usr/local/matlab
        mount -t nfs loire:/usr/local/matlab/R2010a /usr/local/matlab
        /usr/local/matlab/bin/matlab &

 Attention!
     Seule la version LINUX 32bits est disponible.
     Votre processeur doit supporter les instructions SSE2.
     La commande netscape doit pointer vers un navigateur.
     Adobe flashPlayer est utile pour les démonstrations MATLAB.

 Si vous souhaitez utiliser d'autres outils (toolbox), prenez contact avec
 la DSI.

 Des programmes M-files sont disponibles à

    http://www.mathtools.net/
http://www.che.wisc.edu/octave/
(octave est un produit GNU compatible MATLAB) La documentation est en ligne. Elle est aussi disponible à partir de http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/techdoc/index.html

- licence MATLAB


  Le logiciel MATLAB mis à votre disposition sur la machine loire est
  couvert par une licence "académique". Son usage doit donc rester dans
  ce cadre.

  Les licences recherche (académique) : ce type de licence est réservée
  au personnel des laboratoires de recherche académique dont l'ensemble
  des travaux de recherche et leurs résultats profitent à la communauté
  (publication).

  Le SLA (Software Licence Agreement) est très stricte à l'égard de
  l'utilisation de ces licences: Les licences académiques ne doivent
  avoir aucunes finalités commerciales

  Que ce soit pour respecter la notion de licence « académique » décrite
  dans le SLA ou que ce soit pour ne pas entrer en situation de
  concurrence déloyale avec des entités commerciales, nous souhaitons
  attirer votre attention sur l'importance de rester en conformité avec
  l'utilisation des licences académiques.


spatial-econometrics (sommaire)



 Econometrics Toolbox: by James P. LeSage          installé le 2 juillet 2010

 Il s'agit de toolbox pour MATLAB.

  http://www.spatial-econometrics.com/
Les données, les exemples et la documentation sont disponibles file:///usr/local/speco_toolbox/data/
file:///usr/local/speco_toolbox/spexamples/
file:///usr/local/speco_toolbox/doc/
Pour les utiliser, il vous faut rajouter le chemin /usr/local/speco_toolbox/ en incluant les sous répertoires. "Set Path.../Add with Subfolders..."

scilab (sommaire)


 scilab   version 4.1.2-6                  installée le 5 fev 2009

 scilab - Matrix-based scientific software package (a la Matlab and Xmath)

 scilab se retouve dans le menu Debian/Applications/Sciences/Mathématiques/
 ou en tapant

  scilab &

 Voir  http://www.scilab.org
Scilab Image and Video Processing toolbox n'a pas été installé. Si vous voulez l'utiliser, contactez-nous.

octave (sommaire)


 octave3.0 - Langage GNU Octave pour le calcul numérique (branche 3.0)

 S'utilise en mode texte en tapant:

  octave

 ou en mode X

  qtoctave &

 On retrouvera octave et qtoctave dans le menu
         Debian/Applications/Sciences/Mathématiques

 Voir "man octave"

 la documentation en pdf
     file:///usr/share/doc/octave3.0-doc/
la documentation en html file:///usr/share/doc/octave3.0-htmldoc/faq/Octave-FAQ.html
file:///usr/share/doc/octave3.0-htmldoc/interpreter/index.html
file:///usr/share/doc/octave3.0-htmldoc/liboctave/index.html

maxima (sommaire)


 maxima version 5.13.0-3.1+b1               installée le 5 fev 2009

  Maxima is a fully symbolic computation program.  It is full featured doing
  symbolic manipulation of polynomials, matrices, rational functions,
  integration, Todd-coxeter methods for finite group analysis, graphing,
  multiple precision floating point computation.

  xmaxima se trouve dans le menu Debian/Applications/Educatif

  xmaxima &
      pour lancer l'interface X


  La documentation est disponible dans le répertoire
   file:///usr/share/doc/maxima-doc/
file:///usr/share/doc/maxima-doc/html/maxima_toc.html

R (sommaire)


  R version 2.7.1                              installée le 28 jan 2009

  R is `GNU S' - A language and environment for statistical computing
  and graphics. R is similar to the award-winning S system, which was
  developed at Bell Laboratories by John Chambers et al. It provides a
  wide variety of statistical and graphical techniques (linear and
  nonlinear modelling, statistical tests, time series analysis,
  classification, clustering, ...).

   http://www.r-project.org/
R se trouve dans le menu Debian/Applications/Sciences/Analyse de données ou se lance tapant R man R La documentation se trouve dans le répertoire file:///usr/share/doc/r-doc-pdf/manual/

- Quelques commandes


     q()          pour quitter
     help()       pour afficher de l'aide
     help.start() pour lancer le navigateur et afficher la documentation
                  Choississez la rubrique "Packages"

- packages complémentaires


  mclust, kohonen, clValid, fpc installés le 28 jan 2009

 Si vous êtes intéressés par d'autres packages, contactez-nous.


xfm (sommaire)


  xfm version 1.5.4-1                                   le 21 nov 2008

  xfm, FileMgr, X file and applications manager

  Notes:

    Pour redéfinir, une application, choisissez Edit dans le menu obtenu
    en cliquant sur le pictograme avec le bouton droit

    Par exemple, le bouton mozilla peut être redéfini
        Push action = exec mozilla
        Drop action = au choix parmi les trois lignes suivantes
           exec mozilla -remote "OpenURL(file:///$PWD/$*,new-window)"
           exec mozilla "file:///$PWD/$*"
           mozilla -remote "OpenURL(file:///$PWD/$*,new-window)"
               || mozilla "file:///$PWD/$*"

    Le dossier Mountable et ses boutons cdrom0 et floppy0 sont sans effet.

    Le bouton Printer est à adapter à vos besoins.

    Un clic droit dans la fenêtre Apps.xfm vous permet d'ajouter d'autres
    boutons (Install) ou dossier (Install Group)

  Votre configuration xfm se trouve dans le répertoire ~/.xfm


OpenOffice (sommaire)


 OpenOffice.org                version 2.4.1 installée le 25 novembre 2008

 Open Office se lance en tapant
      soffice &
 ou directement à travers le menu Debian/Applications/Bureautique

   soffice -h
      donne les différents paramètres utilisables

   soffice -show document.odp
      démarre la présentation du fichier doument.odp

   soffice -p fichier.doc
      imprime fichier.doc sans l'afficher sur l'imprimante par défaut

   soffice -view fichier.doc
      affiche le document sans pouvoir le modifier

- dictionnaires


 Les dictionnaires suivants ont été installés:

     Français Réforme 1990 & Classique (France)
     English (United Kingdom)
     English (United States)

 Si vous souhaitez d'autres dictionnaires, contactez-nous.


pdf (sommaire)


- xpdf


  xpdf est disponible

- acroread


  adobereader-fra    version 8.1.3            installée le 5 fev 2009
			     9.4.2			  23 mai 2011
  acroread &

  ou dans le menu bureautique de XFCE4.


imagemagick (sommaire)


 Imagemagick est un ensemble de programmes pour manipuler divers formats
 d'image (JPEG, TIFF, PhotoCD, PBM, XPM, etc.). Toutes les manipulations
 peuvent s'effectuer aussi bien à partir de la ligne de commande qu'à
 travers une interface graphique X11 (« display »)

 display nom_du_fichier_image &
     affiche l'image


gimp (sommaire)


 gimp - programme de manipulation d'images GNU

 GIMP vous permet de dessiner, peindre, éditer des images et bien plus ! Il
 inclut des fonctionnalités et des greffons provenant d'autres célèbres
 programmes d'édition et de traitement.


gnuplot (sommaire)


 gnuplot version 4.2.2-1.2                   installé le 5 dec 2008

 gnuplot - A command-line driven interactive plotting program

   Voir "man gnuplot"
    file:///usr/share/doc/gnuplot-doc/html/index.html
gnuplot est un programme permettant de tracer des fonctions à partir de commandes intéractives. Il peut être utilisé pour tracer des fonctions ou des données en deux et trois dimensions dans différents formats. gnuplot dispose d'une aide en ligne (commande help). Des exemples sont fournis dans /usr/share/doc/gnuplot-doc/examples/. Pour les voir, vous devez mkdir gnuplot cd gnuplot cp /usr/share/doc/gnuplot-doc/examples/* . gunzip *.gz gnuplot load "all.dem" exit

- Comment lire ou imprimer la documentation?


   ls /usr/share/doc/gnuplot-doc/
   gv /usr/share/doc/gnuplot-doc/gnuplot.ps.gz &
   gv /usr/share/doc/gnuplot-doc/ps_guide.ps.gz
   view /usr/share/doc/gnuplot-doc/ps_file.doc.gz
   gv /usr/share/doc/gnuplot-doc/gpcard.ps.gz &

- Comment exécuter une commande du shell sous gnuplot?


       ! permet d'exécuter une commande unix
       !ls
         donne donc la liste des fichiers
       !lpq
         donne la liste des jobs en attente d'impression


- Comment obtenir une sortie-papier de votre tracé?


   vous taperez par exemple :

        set output "g.ps"
        set terminal postscript color
        replot
        ! lpr -Pphaser780 g.ps

   replot referra le dernier tracé mais en postscript et dans le fichier
   g.ps que vous pourrez imprimer par la commande UNIX, lpr -Pphaser780 g.ps

        ! gv g.ps &

   vous permet de voir avant d'imprimer


smb (sommaire)


  Pour accèder à vos données situées sur votre PC, vous pouvez utiliser
  le client SMB. Votre PC doit être configuré en serveur de fichier
  (serveur samba sous LINUX) et accepter les connexions depuis la
  machine loire 161.3.152.12.


  mkdir mnt
  mkdir mnt/cri02
  smbmount //cri02/beberjm $HOME/mnt/cri02 -o username=beberjm,rw

     cri02 est une machine linux avec un serveur samba 3.0
     Cette commande monte le répertoire d'accueil de beberjm@cri02
     dans le répertoire local $HOME/mnt/cri02

  smbumount  $HOME/mnt/cri02

  mkdir -p $HOME/mnt/cri01/logitek-pc
  smbmount //CRI01/logitek-pc $HOME/mnt/cri01/logitek-pc \
      -o ip=161.3.192.27,workgroup=CRITER,guest,rw

  smbumount $HOME/mnt/cri01/logitek-pc


X (sommaire)


- Comment réinitialiser la mirre de login Debian?

       Utilisez CTRL-R ou CTRL-C

- Comment se connecter en mode "failsafe"?


    Comment obtenir uniquement un xterm à partir de la mirre login de DEBIAN?

         donnez vôtre login et mot de passe et validez avec la touche F1
      note:
         On passe du champ Login au champ Password par la touche Tabulation

- Comment modifier les ressources?


    vi .Xresources
       pour modifier les ressources X
    xrdb -merge $HOME/.Xresources
       pour les prendre en compte immédiatement


www (sommaire)


(English follows)

 Pour créer votre site web personnel, deux possibilités s'offrent à vous:

    soit vous utilisez cette machine  avec comme URL
           http://webperso.univ-st-etienne.fr/~LOGIN_NAME
soit vous utilisez le service http://perso.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME
Il faut créer un fichier index.html ou index.htm Seuls les personnes ayant un compte sur cette machine peuvent utiliser la première possibilité. Nous vous conseillons d'utiliser la seconde. Tous les membres de l'UJM peuvent l'utiliser. Rappel: Conformément à la charte, ces sites sont réservés exclusivement à vos activités universitaires et professionnelles.

- Comment déposer des informations sur webperso.univ-st-etienne.fr?


   Dans votre répertoire d'accueil sur cette machine, créez un
   répertoire de nom public_html

                     mkdir ~/public_html

   autorisez les accès à ce répertoire

                     chmod o=x $HOME
                     chmod o=rx ~/public_html

   dans ce répertoire, déposez votre premier document html sous le nom
   home.html ou index.html et autorisez les accès à ce document, ainsi qu'à
   tous les autres.

                     chmod o=r ~/public_html/index.html
                     chmod o=r ~/public_html/*

    http://webperso.univ-st-etienne.fr/~LOGIN_NAME
sera l'URL. Notez la présence du signe ~ devant votre nom de login Notes: http://ondenon.univ-st-etienne.fr/~LOGIN_NAME
est aussi fonctionnel

- Comment déposer des informations sur perso.univ-st-etienne.fr?


    http://perso.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME
Notez l'absence du signe ~ devant votre nom de login. Ce site n'est pas lié à votre compte UNIX. Pour déposer des documents sur ce site personnel, vous pouvez passer par l'ENT https://ent.univ-st-etienne.fr/
à la rubrique Services Collaboratifs/Mes dossiers/www utiliser le protocole webdav (cadaver, sitecopy, konqueror etc...) avec l'adresse webdav://perso.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME Vous pouvez ensuite modifier ces documents avec mozilla et la fonction File/Publish accessible depuis File/Edit Page. Note: "http://perso.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME" est la même chose que "http://dossier.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME/www"

- How to update your personnal site on perso.univ-st-etienne.fr ?


    http://perso.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME
You have to put there an index.html or index.htm file. Please note there is no ~ before your login name. This site is not related to your unix account. To put documents on this personnal site, you can either use ENT https://ent.univ-st-etienne.fr/
in section Espace personnel / Mes Dossiers / Mes Dossiers / www or use webdav protocol (with Windows 7 explorer, Nautilus under Linux or other tools like cadaver, sitecopy, konqueror, etc.) with following URL: webdav://perso.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME Nota: "http://perso.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME" is same as "http://dossier.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME/www"

- Comment mettre des fichiers à disposition sur INTERNET?


   Voir  http://dossier.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME/public
Ils seront aussi accessibles en WEBDAV

- Où stocker les fichiers auxquels je veux accèder du monde entier?


   Voir  http://dossier.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME/prive
Ils me seront aussi accessibles en WEBDAV

webdav (sommaire)


 Plusieurs zones sont à votre disposition. Il s'agit de zones de dépôt de
 documents et non de site www. La réference
       http://dossier.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME/public/
donne la liste des fichiers disponibles et n'affiche pas le contenu de index.html http://dossier.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME/public/
accessible en lecture du monde entier par tous accessible en écriture à vous seul http://dossier.univ-st-etienne.fr/LOGIN_NAME/prive/
accessible en lecture-écriture du monde entier par vous seul http://webdav-ldap.univ-st-etienne.fr/files/perso/
Ils existent aussi des zones pour chaque groupe instutionnel de l'université. http://webdav-ldap.univ-st-etienne.fr/files/groups/

- Comment accèder à mes fichiers stockés sur un serveur webdav?


   De nombreux logiciels permettent cette accès. En voici quelques uns
   Les exemples ci-dessous utilisent le login name toto


- nd


  nd  -v  http://dossier.univ-st-etienne.fr/toto/public/essai.txt
pour obtenir des informations sur le fichier en question nd -d http://dossier.univ-st-etienne.fr/toto/public/essai.txt
pour détruire le fichier essai.txt nd -p essai.txt http://dossier.univ-st-etienne.fr/toto/public/essai.txt
pour mettre en place le fichier essai.txt. Votre login et password vous sera demandé. (celui de la messagerie)

- cadaver


   cadaver   http://dossier.univ-st-etienne.fr/"votre_login"/prive
pour utiliser l'éditeur de texte joe avec cadaver export EDITOR="joe -asis -rmargin 72" pour utiliser Open Office export EDITOR="soffice" cadaver http://dossier.univ-st-etienne.fr/"votre_login"/prive
ls permet d'obtenir la liste des fichiers edit "nom_du_fichier" permet de modifier le fichier choisi avec l'éditeur de texte défini par la variable EDITOR cd "nom_du_répertoire)" pour se déplaver dans l'arborescence distante Les répertoires ont nommés collection Coll: en début de ligne get nom_de_fichier pour rapatrier localement le fichier cité mget * pour rapatrier tous les fichiers mais pas les répertoires mkcol dossier pour créer un répertoire nommé dossier quit pour se déconnecter Voir man cadaver Voir http://www.webdav.org/cadaver/

- openoffice


   Quand on vous demande un nom de fichier, donnez
   sa référence sous la forme
       http://dossier.univ-st-etienne.fr/"votre_login"/prive/fichier

- emacs (avec eldav)


    Donnez comme nom de fichier à find-file (CTRL-x CTRL-f)
    :http://dossier.univ-st-etienne.fr/toto/public/essai.txt

    Ne pas oublier le : initial. Les login et password vous seront demandés.


- mozilla


   donnez l'URL  http://dossier.univ-st-etienne.fr/toto/public/
Avec le menu File/Edit Page/, on peut modifer le fichier Avec le menu Window/Composer/, on peut composer un texte et le déposer avec File/Publish/. C'est limité au fichier de type html Publish Site Name = donner un nom de site quelconque Page Title = donner un texte qui apparait dans le bord haut de la fenêtre FileName = donner le nom du fichier Site subdirectory for this page = le sous répertoire si besoin Settings Site Name = le nom du site Publishing adress = http://dossier.univ-st-etienne.fr/toto/public/
HTTP adress of your home page = laissez vide Utilisez le bouton Publish pour déposer le document

jeux_de_caractères-MS-Windows (sommaire)


- Comment afficher un texte encodé en windows-1252?


   Rajouter au début du fichier la ligne
     Content-type: text/plain; charset="windows-1252"
   suivie d'une ligne vide
   et afficher le texte avec mozilla.

- Comment passer d'un texte en windows-1252 à un texte en iso8859-15?


   trcs -f cp1252 -t iso-8859-15 maplesoft.txt

   trcs -l
     vous donnera tous les jeux de caractères qu'il connait

- Comment visualiser un message en texte windows-1252 dans exmh?


   Modifier $HOME/.mailcap en rajoutant la ligne

   text/plain; trcs -f cp1252 -t iso-8859-15 '%s' | less; needsterminal

   Il faut redémarrer exmh.

   Puis dans le menu obtenu en cliquant sur le texte du message avec le
   bouton droit, il faut utiliser "View using mailcap rule..."


dump (sommaire)


- Comment visualiser le contenu d'un fichier en hexadécimal?


-- hexdump

       hexdump -C login.php.htm

       donnera le code hexa et le caractère correspondant

-- vim

     en utilisant la commande :%!xxd
     et pour revenir  :%!xxd -r

     ou dans le menu Outils de gvim


Tex_LaTeX (sommaire)


- TeXLive2008


  TeXLive a été installé à partir du DVD TeXCol2008

  Pour utiliser cette version, vous devez définir les variables ci-dessous:

    PATH=/usr/local/texlive/2008/bin/i386-linux:$PATH
    export PATH
    MANPATH=/usr/local/texlive/2008/texmf/doc/man:$MANPATH
    export MANPATH
    INFOPATH=/usr/local/texlive/2008/texmf/doc/info:$INFOPATH
    export INFOPATH

  Vous pouvez rajouter ces lignes dans $HOME/.bashrc et $HOME/.xsession

- taille papier


  Elle est définie par défaut à A4.

- Comment faire pour prendre en compte les caractères accentués?


 \usepackage[french]{babel}
 \usepackage[T1]{fontenc}

- xlatex


  xlatex   version 3.3c modifiée par nos soins               le 4 fev 2009

  xlatex a été compilé et mis en place par nos soins.

  xlatex est une interface d'utilisation de TeX et LaTeX. Elle permet

    + éditer le fichier source .tex
    + soumettre le document .tex  au processeur LaTeX or TeX
    + visualiser le fichier 'dvi' ou 'ps'
    + imprimer le document sur une imprimante postscript (après avoir
      converti le .dvi en .ps)
    + voir la file d'attente d'impression
    + appeler l'éditeur de graphique, xfig

  xlatex utilise la version de TeX accessible dans le chemin d'accès ($PATH)

  Tapez:
    xlatex &
  Ou choisissez xlatex dans le menu Debian/Applications/Bureautique/

- TexLive2007


  Les paquets texlive de DEBIAN ont été installés comme dépendances des
  outils liés à TeX, vim-latexsuite, auctex, lyx...

- vim-latexsuite


 vim-latexsuite - view, edit and compile LaTeX documents from within Vim

 :help latex-suite - for vim-latexsuite help
 :help latex       - for LaTeX help

- auctex


 auctex - integrated document editing environment for TeX etc

- lyx


 LyX est un système de préparation de documents. Il est excellent si vous
 voulez écrire des articles scientifiques et techniques complexes avec des
 mathématiques, des références croisées, des bibliographies, des index,
 etc...

- texmacs


 texmacs - WYSIWYG mathematical text editor using TeX fonts


- texmaker


  installé le 23 fev 2009

  texmaker - Éditeur LaTeX multi-plate-forme

- nettoie


  installé le 8 octobre 2009

  Un petit script maison qui permet de supprimer les fichiers de travail
  de TEX/LaTeX. Merci à son auteur.

- Documentation


  http://www.gutenberg.eu.org/
http://www.tuteurs.ens.fr/logiciels/latex/

ftp (sommaire)


 Cette machine n'héberge plus de serveur FTP.

 Pour vos transferts, utilisez la commande sftp ou filezilla avec le
 protocole sftp.



utilitaires_X (sommaire)


 Vous trouverez ici quelques utilitaires X utiles. Tous ne sont pas cités.

- xpostit


 xpostit - simple postit program on X with I18N support

- terminal


  xterm

  xfce4-terminal
      Il peut être utile de dévalider les raccourcis clavier.
      Voir le menu Editer/Préférences.../Raccourcis/
      Notamment avec des apllicatiopns utilisant les mêmes raccourcis
      clavier (mc, ...)


- diagrammes


 dia - Éditeur de diagrammes

 Vous trouverez dia dans le menu Debian/Applications/Sciences/Ingéniérie
 ou en tapant

   dia &

- xfig


 xfig - Programme de création graphique sous X11

 Vous retrouverez xfig dans le menu Debian/Applications/Dessin et Image
 ou en tapant:

  xfig &


ViennaRNA (sommaire)


 Vienna RNA version 1.8.2             installée le 19 mai 2009

  http://www.tbi.univie.ac.at/RNA/
The Vienna RNA Package consists of a C code library and several stand-alone programs for the prediction and comparison of RNA secondary structures. Ribonucleic acid (RNA) Voir les man correspondants

Statistics-Gap (sommaire)


 Statistics-Gap version 0.10         installée le 19 mai 2009

 man Statistics::Gap

 Statistics-Gap utilise CLUTO. La version cluto-2.1.2a a été installée.

  CLUTO is a software package for clustering low- and high-dimensional
  datasets and for analyzing the characteristics of the various clusters.
  CLUTO is well-suited for clustering data sets arising in many diverse
  application areas including information retrieval, customer purchasing
  transactions, web, GIS, science, and biology.

  /usr/local/cluto-2.1.2/manual.pdf (71 pages en anglais)


FreeFem++ (sommaire)


 FreeFem++ version 3.3                      installée le 3 juin 2009

 FreeFem++ is an implementation of a language dedicated to the finite
 element method. It enables you to solve Partial Differential Equations
 (PDE) easily.

 Voir   http://www.freefem.org/ff++/index.htm
http://www.projet-plume.org/fr/fiche/freefem
file:///usr/local/share/freefem++/freefem++doc.pdf
/usr/local/share/freefem++/3.3/ Pour tester, vous pouvez cd /usr/local/share/freefem++/3.3/examples++ FreeFem++ demo.edp dans la fenêtre graphique obtenue, tapez <Entrée>...

Getfem++ (sommaire)


 Getfem             version 4.0.0 compilée et installée le 28 dec 2009

  http://home.gna.org/getfem/getfem_intro.html
The Getfem++ project focuses on the development of a generic and efficient C++ library for finite element methods. The goal is to provide a library allowing the computation of any elementary matrix (even for mixed finite element methods) on the largest class of methods and elements, and for arbitrary dimension (i.e. not only 2D and 3D problems). Voir http://home.gna.org/getfem/doc.html
La configuration a été faite avec ./configure --enable-matlab --enable-matlab-rpc Pour utiliser avec MATLAB addpath /usr/local/getfem_toolbox/ Vous pouvez insérerer ces commandes dans un fichier startup.m situé dans le répertoire à partir duquel vous lancez matlab. Au lancement de matlab, startup.m est exécuté automatiquement. Par exemple, sous MATLAB, on tape: >> run /usr/local/getfem_toolbox/tests/demo_laplacian.m ATTENTION!, Il y a un souci Warning: Function /usr/local/getfem_toolbox/private/assert.m has the same name as a MATLAB builtin. We suggest you rename the function to avoid a potential name conflict. Si vous obtenez, getfem_server: /usr/local/matlab/R2008b/sys/os/glnx86/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.9' not found (required by getfem_server) Vous pouvez dans MATLAB, commencez par définir LD_PRELOAD >> setenv('LD_PRELOAD','/lib/libgcc_s.so.1:/usr/lib/libstdc++.so.6');

sshfs (sommaire)


  sshfs                        installée le 4 juin 2009

  sshfs permet de monter un répertoire distant situé sur un serveur SSH

  par exemple, pour monter le répertoire d'accueil de l'utilisateur berlier
  de la machine cri02.

     mkdir mnt
     mkdir mnt/cri02
     sshfs berlier@cri02: mnt/cri02

   et ne pas oublier

     fusermount -u mnt/cri02

   pour démonter

- Comment accèder aux fichiers stockés sur loire?


 A partir d'une machine MS-Windows, vous pouvez utiliser le produit
 décrit ici (le 16 juin 2010):

  https://www.freenux.fr/Acceder-depuis-Windows-a-un.html
N'oubliez pas d'indiquer dans "Server Root" votre répertoire d'accueil (valeur obtenue par la commande echo $HOME) Votre répertoire est ensuite accessible comme un disque, N: par exemple. A partir d'une machine LINUX ou d'un MaC, utilisez simplement sshfs.

paraview (sommaire)


  paraview version  3.2.2-1                      installé le 10 juin 2009

  Parallel Visualization Application

  installé à partir du paquet inclus dans la distribution LINUX DEBIAN

  Voir man paraview
        file:///usr/share/doc/paraview/html/
http://www.paraview.org/

subversion (sommaire)


 subversion version 1.5.1                        installé le 23 mai 2011

 Subversion is a free/open source version control system (VCS). That is,
 Subversion manages files and directories, and the changes made to them,
 over time. This allows you to recover older versions of your data or
 examine the history of how your data changed. In this regard, many people
 think of a version control system as a sort of "time machine."

 Voir man svn
      svn help



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